Mortal Kombat 11 Ultimate es la versión definitiva de la última entrega de la afamada saga de lucha, que a pesar de tener gráficos tridimensionales se sigue desarrollándo lateralmente para conservar toda su esencia, que añade al elenco de luchadores a Mileena, Rain y Rambo. Pero esto no es todo, ya que incluye las actualizaciones más recientes (con  los Friendships y Fatalities de fase) junto con más trajes, escenarios y otros extras.

La historia del juego base se centra en Raiden, quien ha asumido un poder oscuro para intentar defender la Tierra de las diferentes amenazas, lo que altera el equilibrio entre la luz y la oscuridad y algunas líneas temporales. Aquí entra en juego Kronika, un ser que controla el tiempo y busca reparar este estropicio, uniendo todas las líneas temporales en una sola para reunir al pasado junto al presente y hacer que el actual Raiden deje de existir. Por su parte, Aftermath continúa donde acaba esta trama, con Liu Kang asumiendo el papel de nuevo protector y Guardián del Tiempo al derrotar a Kronika. Tras unos sucesos que no detallaremos, se ve obligado a viajar nuevamente por el tiempo para intentar conservar en buen estado el Reloj de arena que permite mantener el equilibrio, haciendo alianzas inesperadas por el camino.